Chip-atlas 使い方
WebDec 11, 2024 · 本講習では、RefExを使って個々の遺伝子の発現プロファイルを調べる方法に始まり、遺伝子発現データの結果を生物学的に解釈するためのツール(ChIP-Atlas・DAVID・Metascape・Enrichr)の使い方、 … http://chip-atlas.org/view?id=SRX035992
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WebRefEx と ChIP-Atlas 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) ... ChIP-Atlas の 使い方 in 統合TV Peak Browser • ChIP-Atlasを使って既報のChIP-seqデータをま ... WebSample information curated by ChIP-Atlas Antigen Antigen Class TFs and others Antigen Nr1h3. Cell type Cell type Class Liver Cell type Liver ... ChIP LXR antibody vendor/provider Jakobsson et al. 2009. Sequenced DNA Library library_name GSM864668: LXR ChIP WT Bexarotene library_strategy ChIP-Seq library_source
http://chip-atlas.org/ http://chip-atlas.org/view?id=SRX118170
WebApr 22, 2024 · inutano commented on Apr 26, 2024. Last week our backend server received too many jobs and temporarily took a long time to run the Enrichment Analysis jobs. Now the issue is solved and we'll try to avoid this kind of problem happen in the future. inutano closed this as completed on Apr 26, 2024. Sign up for free to join this conversation on ... WebJan 23, 2024 · ChIP-Atlas は、論文などで報告された ChIP-seq データを閲覧し、利活用するためのウェブサービスです。データ処理の知識やスキルがない方でも簡単に利用できます。
WebDec 18, 2024 · ChIP-Atlas收集整理了SRA 数据库 中的大量chip_seq数据,并基于这些原始数据进行了后续分析,将分析结果整理成在线服务并发布,方便检索与查询,网址如下. 下载SRA原始数据,采用 sratoolkit 转换成fastq, 然后用 bowtie2 比对参考基因组,用 macs2 进行peak calling。. 官网 ...
WebChIP-Atlas の使い方が日本語で詳述されています。 薬の作用機序の解明に活用した論文 (BMC Bioinform, 2024) PDF 九工大の山西芳裕 先生との共同研究で、薬剤で発現変動 … software to open pdf files free downloadWebNov 19, 2024 · In Fawn Creek, there are 3 comfortable months with high temperatures in the range of 70-85°. August is the hottest month for Fawn Creek with an average high … software to open shapefilesWebNumber of total reads 14813227 Reads aligned (%) 61.8 Duplicates removed (%) 16.3 Number of peaks 2193 (qval . 1E-05) slow pitch jigging rods top 10http://chip-atlas.org/enrichment_analysis software to open php fileWebChIP-Atlasは以下の4つのサービスで構成されています。. 1) Peak Browser. ChIP-seq データをゲノムブラウザー上に表示し、何がどこに結合しているかを一目で分かるようにしています。. 2) Target Genes. 転写因子からターゲット遺伝子を予測します。. 3) Colocalization. 転写 ... software to open iso filessoftware to open large xml filesWebDec 1, 2015 · Taxonomy ID: 10116. データベースの説明. ChIP-Atlas は Sequence Read Archive で公開されている既報のChIP-Seqデータを再解析することによって様々な解析結果を提供し、またユーザデータの解析を可能にするデータベースおよびそのウェブインターフェースである ... software to open pdf files